Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC61.86■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC61.85■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC61.84■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC61.83■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC61.83■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC61.82■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC61.82■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.81■■■■■ 7.49
NISCHQ9Y2I1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC61.8■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC61.8■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC61.79■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC61.79■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC61.79■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC61.78■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC61.78■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC61.76■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC61.76■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC61.75■■■■■ 7.48
NISCHQ9Y2I1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC61.73■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC61.73■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC61.73■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.72■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC61.69■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC61.69■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC61.69■■■■■ 7.47
NISCHQ9Y2I1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.68■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC61.66■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC61.65■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC61.65■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC61.65■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC61.64■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC61.64■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.63■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.62■■■■■ 7.46
NISCHQ9Y2I1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.62■■■■■ 7.45
NISCHQ9Y2I1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC61.6■■■■■ 7.45
NISCHQ9Y2I1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC61.6■■■■■ 7.45
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC61.57■■■■■ 7.45
NISCHQ9Y2I1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC61.57■■■■■ 7.45
NISCHQ9Y2I1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC61.54■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.54■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.54■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC61.53■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC61.53■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC61.53■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.52■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC61.52■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC61.51■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC61.51■■■■■ 7.44
NISCHQ9Y2I1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.49■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.49■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC61.48■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.46■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC61.46■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC61.43■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.43■■■■■ 7.43
NISCHQ9Y2I1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC61.43■■■■■ 7.42
NISCHQ9Y2I1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC61.41■■■■■ 7.42
NISCHQ9Y2I1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.39■■■■■ 7.42
NISCHQ9Y2I1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.36■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.36■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC61.36■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC61.33■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC61.33■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC61.31■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC61.31■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC61.31■■■■■ 7.41
NISCHQ9Y2I1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC61.29■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC61.29■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC61.29■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC61.29■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC61.28■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC61.28■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC61.28■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC61.28■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.25■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC61.25■■■■■ 7.4
NISCHQ9Y2I1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC61.24■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC61.23■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.23■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC61.22■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.21■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC61.21■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC61.2■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC61.19■■■■■ 7.39
NISCHQ9Y2I1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.18■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC61.18■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC61.17■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC61.17■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC61.16■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.15■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC61.15■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC61.15■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.13■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.13■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC61.12■■■■■ 7.38
NISCHQ9Y2I1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC61.11■■■■■ 7.37
NISCHQ9Y2I1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC61.1■■■■■ 7.37
NISCHQ9Y2I1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC61.1■■■■■ 7.37
NISCHQ9Y2I1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC61.07■■■■■ 7.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms