Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
STUB1Q9UNE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STUB1Q9UNE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STUB1Q9UNE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms