Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNPO2Q9UMS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNPO2Q9UMS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNPO2Q9UMS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNPO2Q9UMS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNPO2Q9UMS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNPO2Q9UMS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms