Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCOLCE2Q9UKZ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCOLCE2Q9UKZ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms