Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2IRD1Q9UHL9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2IRD1Q9UHL9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms