Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDRG3Q9UGV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG3Q9UGV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG3Q9UGV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDRG3Q9UGV2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms