Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TMOD3Q9NYL9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TMOD3Q9NYL9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMOD3Q9NYL9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TMOD3Q9NYL9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TMOD3Q9NYL9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TMOD3Q9NYL9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
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