Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NDE1Q9NXR1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDE1Q9NXR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDE1Q9NXR1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms