Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RLIMQ9NVW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RLIMQ9NVW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLIMQ9NVW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLIMQ9NVW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLIMQ9NVW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms