Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM100Q9NV29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM100Q9NV29 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM100Q9NV29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM100Q9NV29 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms