Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTG1Q9NSN8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNTG1Q9NSN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTG1Q9NSN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG1Q9NSN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTG1Q9NSN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTG1Q9NSN8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms