Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
TULP4Q9NRJ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TULP4Q9NRJ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
TULP4Q9NRJ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TULP4Q9NRJ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TULP4Q9NRJ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TULP4Q9NRJ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms