Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms