Protein–RNA interactions for Protein: Q9H841

NIPAL2, NIPA-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL2Q9H841 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms