Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA6CQ9H3T2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA6CQ9H3T2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA6CQ9H3T2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6CQ9H3T2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms