Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS11Q9H270 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS11Q9H270 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS11Q9H270 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS11Q9H270 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS11Q9H270 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS11Q9H270 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS11Q9H270 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS11Q9H270 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS11Q9H270 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms