Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCSER1Q9C0I3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCSER1Q9C0I3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCSER1Q9C0I3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CCSER1Q9C0I3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCSER1Q9C0I3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms