Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CNTNAP4Q9C0A0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CNTNAP4Q9C0A0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CNTNAP4Q9C0A0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNTNAP4Q9C0A0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
CNTNAP4Q9C0A0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CNTNAP4Q9C0A0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNTNAP4Q9C0A0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTNAP4Q9C0A0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTNAP4Q9C0A0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms