Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP9-8Q9BYQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms