Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-6Q9BXR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-6Q9BXR3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVK-6Q9BXR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-6Q9BXR3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-6Q9BXR3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms