Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MXD3Q9BW11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MXD3Q9BW11 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MXD3Q9BW11 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MXD3Q9BW11 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
MXD3Q9BW11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MXD3Q9BW11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
MXD3Q9BW11 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MXD3Q9BW11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MXD3Q9BW11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MXD3Q9BW11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MXD3Q9BW11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms