Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
FYCO1Q9BQS8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
FYCO1Q9BQS8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
FYCO1Q9BQS8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
FYCO1Q9BQS8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FYCO1Q9BQS8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
FYCO1Q9BQS8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
FYCO1Q9BQS8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
FYCO1Q9BQS8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms