Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS2Q99743 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS2Q99743 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS2Q99743 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms