Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCD1Q96RS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUDCD1Q96RS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD1Q96RS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCD1Q96RS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms