Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TEFMQ96QE5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TEFMQ96QE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TEFMQ96QE5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms