Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PRAC1Q96KF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PRAC1Q96KF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRAC1Q96KF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms