Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NEURL4Q96JN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NEURL4Q96JN8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEURL4Q96JN8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
NEURL4Q96JN8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NEURL4Q96JN8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NEURL4Q96JN8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NEURL4Q96JN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms