Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LINGO1Q96FE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINGO1Q96FE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO1Q96FE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINGO1Q96FE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINGO1Q96FE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms