Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF501Q96CX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF501Q96CX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF501Q96CX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF501Q96CX3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF501Q96CX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF501Q96CX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF501Q96CX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF501Q96CX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms