Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF653Q96CK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF653Q96CK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF653Q96CK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF653Q96CK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms