Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX58Q96C10 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX58Q96C10 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX58Q96C10 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DHX58Q96C10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DHX58Q96C10 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DHX58Q96C10 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DHX58Q96C10 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX58Q96C10 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX58Q96C10 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms