Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS33AQ96AX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS33AQ96AX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms