Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC47Q96A33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC47Q96A33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC47Q96A33 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC47Q96A33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms