Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERGIC1Q969X5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC1Q969X5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERGIC1Q969X5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERGIC1Q969X5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms