Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF5Q969M3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF5Q969M3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YIPF5Q969M3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIPF5Q969M3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms