Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H4Q92759 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2H4Q92759 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2H4Q92759 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms