Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX1Q92499 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX1Q92499 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX1Q92499 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX1Q92499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX1Q92499 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX1Q92499 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX1Q92499 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX1Q92499 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX1Q92499 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX1Q92499 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX1Q92499 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX1Q92499 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX1Q92499 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX1Q92499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX1Q92499 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX1Q92499 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX1Q92499 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX1Q92499 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX1Q92499 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX1Q92499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX1Q92499 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX1Q92499 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX1Q92499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX1Q92499 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX1Q92499 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX1Q92499 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX1Q92499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms