Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf54Q8WWF1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf54Q8WWF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C1orf54Q8WWF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf54Q8WWF1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf54Q8WWF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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