Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA4Q8WW22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA4Q8WW22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA4Q8WW22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms