Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVI0

SMIM4, Small integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4Q8WVI0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM4Q8WVI0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM4Q8WVI0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM4Q8WVI0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM4Q8WVI0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM4Q8WVI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM4Q8WVI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM4Q8WVI0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms