Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R17PQ8TDU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R17PQ8TDU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R17PQ8TDU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms