Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD2

SP7, Transcription factor Sp7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP7Q8TDD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SP7Q8TDD2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SP7Q8TDD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP7Q8TDD2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP7Q8TDD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SP7Q8TDD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP7Q8TDD2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SP7Q8TDD2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP7Q8TDD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms