Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KNL1Q8NG31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KNL1Q8NG31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KNL1Q8NG31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KNL1Q8NG31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNL1Q8NG31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms