Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP2Q8ND30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIBP2Q8ND30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms