Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDPD1Q8N9F7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD1Q8N9F7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDPD1Q8N9F7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD1Q8N9F7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms