Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNE4Q8N205 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNE4Q8N205 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNE4Q8N205 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYNE4Q8N205 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYNE4Q8N205 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNE4Q8N205 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNE4Q8N205 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNE4Q8N205 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNE4Q8N205 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYNE4Q8N205 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNE4Q8N205 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms