Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RPAP2Q8IXW5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RPAP2Q8IXW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RPAP2Q8IXW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPAP2Q8IXW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPAP2Q8IXW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RPAP2Q8IXW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPAP2Q8IXW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RPAP2Q8IXW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPAP2Q8IXW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPAP2Q8IXW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms