Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXM7

ODF3L1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L1Q8IXM7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF3L1Q8IXM7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF3L1Q8IXM7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF3L1Q8IXM7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF3L1Q8IXM7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF3L1Q8IXM7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms