Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA3Q8IXA5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPACA3Q8IXA5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPACA3Q8IXA5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA3Q8IXA5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms