Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM48Q8IWZ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM48Q8IWZ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM48Q8IWZ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms